Durante junio de 2016 se han producido al menos tres incidentes que tienen que ver directamente con la Policía Nacional y ciudadanos nacionales y extranjeros interesados en el tema del Gran Canal Interoceánico.
1. Expulsión de Evan Ellis: el investigador estadounidense llegó a Nicaragua el 13 de junio para realizar una serie de entrevistas con funcionarios nicaragüenses y activistas relacionados al proyecto del Gran Canal Interoceánico. A Ellis lo llegaron a buscar al hotel que se hospedaba, oficiales de policía que lo escoltaron hasta el aeropuerto Augusto C. Sandino la mañana del 14 de junio, para enviarlo de regreso a su país.
2. Detención del fotógrafo Tom Lafay: el ciudadano estadounidense Tom Lafay, quien se encontraba realizando un reportaje fotográfico para Amnistía Internacional en la ruta del Canal, fue detenido el 19 de junio por la Policía Nacional y llevado a la estación de Policía de Nueva Guinea. Horas después de la detención fue puesto en libertad.
3. Detención de Francisca Ramírez y jóvenes de la Caravana Mesoamericana por el Buen Vivir: la mañana del 25 de junio se produjo la detención de al menos siete personas en Nueva Guinea. Un grupo de jóvenes de varias nacionalidades que se encontraban en la vivienda de Pedro Mena, líder anticanal en Nueva Guinea, fueron detenidos por la Policía Nacional. Además de los jóvenes resultó detenida Francisca Ramírez Torres, coordinadora del Consejo Nacional para la Defensa de la Tierra, Lago y Soberanía Nacional.
Además, en los últimos años se han registrado otros incidentes como la expulsión de la fotógrafa belga Michèle Sennesael, quien primero fue arrestada el 21 de diciembre de 2014 y luego expulsada del país.